Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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UBE2V1Q13404 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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UBE2V1Q13404 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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UBE2V1Q13404 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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UBE2V1Q13404 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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UBE2V1Q13404 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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UBE2V1Q13404 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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UBE2V1Q13404 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2V1Q13404 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2V1Q13404 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2V1Q13404 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2V1Q13404 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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UBE2V1Q13404 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2V1Q13404 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2V1Q13404 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2V1Q13404 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2V1Q13404 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2V1Q13404 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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