Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPS1Q13098 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPS1Q13098 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPS1Q13098 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPS1Q13098 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPS1Q13098 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPS1Q13098 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPS1Q13098 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPS1Q13098 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPS1Q13098 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPS1Q13098 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPS1Q13098 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GPS1Q13098 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPS1Q13098 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPS1Q13098 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPS1Q13098 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPS1Q13098 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPS1Q13098 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPS1Q13098 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPS1Q13098 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPS1Q13098 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPS1Q13098 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPS1Q13098 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPS1Q13098 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPS1Q13098 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPS1Q13098 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPS1Q13098 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPS1Q13098 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPS1Q13098 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPS1Q13098 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPS1Q13098 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPS1Q13098 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPS1Q13098 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPS1Q13098 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPS1Q13098 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPS1Q13098 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPS1Q13098 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPS1Q13098 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPS1Q13098 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GPS1Q13098 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
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