Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXI1Q12951 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXI1Q12951 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXI1Q12951 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXI1Q12951 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXI1Q12951 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXI1Q12951 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXI1Q12951 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXI1Q12951 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXI1Q12951 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXI1Q12951 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXI1Q12951 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXI1Q12951 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXI1Q12951 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXI1Q12951 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXI1Q12951 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXI1Q12951 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXI1Q12951 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXI1Q12951 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXI1Q12951 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXI1Q12951 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXI1Q12951 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXI1Q12951 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXI1Q12951 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXI1Q12951 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXI1Q12951 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXI1Q12951 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXI1Q12951 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXI1Q12951 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXI1Q12951 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXI1Q12951 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXI1Q12951 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXI1Q12951 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI1Q12951 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI1Q12951 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI1Q12951 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI1Q12951 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI1Q12951 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI1Q12951 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI1Q12951 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI1Q12951 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI1Q12951 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI1Q12951 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI1Q12951 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI1Q12951 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI1Q12951 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI1Q12951 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI1Q12951 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI1Q12951 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI1Q12951 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI1Q12951 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXI1Q12951 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXI1Q12951 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXI1Q12951 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXI1Q12951 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXI1Q12951 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXI1Q12951 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXI1Q12951 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXI1Q12951 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXI1Q12951 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXI1Q12951 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXI1Q12951 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXI1Q12951 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXI1Q12951 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXI1Q12951 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXI1Q12951 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXI1Q12951 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXI1Q12951 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXI1Q12951 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXI1Q12951 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXI1Q12951 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXI1Q12951 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXI1Q12951 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXI1Q12951 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXI1Q12951 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXI1Q12951 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXI1Q12951 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXI1Q12951 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXI1Q12951 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXI1Q12951 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXI1Q12951 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXI1Q12951 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXI1Q12951 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXI1Q12951 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXI1Q12951 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXI1Q12951 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXI1Q12951 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXI1Q12951 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXI1Q12951 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXI1Q12951 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXI1Q12951 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXI1Q12951 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXI1Q12951 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXI1Q12951 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXI1Q12951 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXI1Q12951 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXI1Q12951 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXI1Q12951 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXI1Q12951 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXI1Q12951 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms