Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 YIM1YMR152W 1098 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 BSD2YBR290W 966 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 ERT1YBR239C 1590 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 ECM30YLR436C 3825 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 AVT2YEL064C 1443 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 MAL13YGR288W 1422 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 ORC5YNL261W 1440 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 REF2YDR195W 1602 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 SUP45YBR143C 1314 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 NOP7YGR103W 1818 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 CIA1YDR267C 993 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 LRS4YDR439W 1044 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 SUF5tG(CCC)O 72 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 URA3YEL021W 804 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 YGR111WYGR111W 1203 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 YGR114CYGR114C 390 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 PIH1YHR034C 1035 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 GIC1YHR061C 945 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 APQ13YJL075C 417 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 YLR339CYLR339C 552 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 PML39YML107C 1005 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 YNL013CYNL013C 378 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 YPL067CYPL067C 597 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 YBR219CYBR219C 384 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 MAD3YJL013C 1548 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 SLM5YCR024C 1479 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 APE4YHR113W 1473 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 HEM1YDR232W 1647 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 BCS1YDR375C 1371 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 PST1YDR055W 1335 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 ARG81YML099C 2643 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 IPK1YDR315C 846 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 MRPS28YDR337W 861 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 PDA1YER178W 1263 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 LIN1YHR156C 1023 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 YHR212W-AYHR212W-A 204 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 BET4YJL031C 984 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 MTD1YKR080W 963 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 SPC3YLR066W 555 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 YAR061WYAR061W 204 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 MID2YLR332W 1131 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 YNL108CYNL108C 813 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 TRS20YBR254C 528 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 CIR2YOR356W 1896 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 YPR196WYPR196W 1413 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 ART10YLR392C 1557 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 UME1YPL139C 1383 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 AIM10YER087W 1731 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 YLL058WYLL058W 1728 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 YHR020WYHR020W 2067 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 YCR001WYCR001W 315 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 SCM3YDL139C 672 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 DAS2YDR020C 699 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 YPT1YFL038C 621 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 YIL163CYIL163C 354 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 RFC2YJR068W 1062 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 GPI12YMR281W 915 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 COX5AYNL052W 462 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 PNO1YOR145C 825 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 RRG8YPR116W 834 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 MRP2YPR166C 348 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 MRPL37YBR268W 318 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 PRP2YNR011C 2631 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 CHO1YER026C 831 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 SYS1YJL004C 612 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 YJL218WYJL218W 591 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 YJR071WYJR071W 369 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 EMG1YLR186W 759 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 YHC1YLR298C 696 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 DUS4YLR405W 1104 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 YOX1YML027W 1158 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 OGG1YML060W 1131 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 YNR040WYNR040W 771 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 YPQ1YOL092W 927 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 KTR1YOR099W 1182 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 YPL034WYPL034W 498 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 YBR113WYBR113W 483 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 snR30snR30 606 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 YCL049CYCL049C 939 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 PHO12YHR215W 1404 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 PHO11YAR071W 1404 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 STT3YGL022W 2157 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 BIM1YER016W 1035 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 SRB5YGR104C 924 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 FOL2YGR267C 732 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 HTD2YHR067W 843 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 TRR2YHR106W 1029 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 AIM33YML087C 939 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 PTH2YBL057C 627 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 PFA3YNL326C 1011 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 YOR343CYOR343C 327 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 SMX3YPR182W 261 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 SMP1YBR182C 1359 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 YCK1YHR135C 1617 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 RUD3YOR216C 1455 nt6.02□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 YEH1YLL012W 1722 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 RGL1YPL066W 1440 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 YDL172CYDL172C 480 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 YDL186WYDL186W 834 nt6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.4 ms