Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RIPPLY1Q0D2K3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms