Protein–RNA interactions for Protein: Q07011

TNFRSF9, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF9Q07011 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF9Q07011 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms