Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
REG3AQ06141 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
REG3AQ06141 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
REG3AQ06141 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
REG3AQ06141 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
REG3AQ06141 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
REG3AQ06141 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
REG3AQ06141 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
REG3AQ06141 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
REG3AQ06141 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
REG3AQ06141 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
REG3AQ06141 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
REG3AQ06141 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
REG3AQ06141 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
REG3AQ06141 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms