Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MC1RQ01726 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms