Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFKB2Q00653 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NFKB2Q00653 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NFKB2Q00653 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
NFKB2Q00653 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFKB2Q00653 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFKB2Q00653 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFKB2Q00653 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFKB2Q00653 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFKB2Q00653 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFKB2Q00653 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFKB2Q00653 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKB2Q00653 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKB2Q00653 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKB2Q00653 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKB2Q00653 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKB2Q00653 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKB2Q00653 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKB2Q00653 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKB2Q00653 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms