Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK6Q00534 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDK6Q00534 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDK6Q00534 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDK6Q00534 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CDK6Q00534 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK6Q00534 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK6Q00534 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK6Q00534 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK6Q00534 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK6Q00534 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK6Q00534 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK6Q00534 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK6Q00534 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK6Q00534 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK6Q00534 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK6Q00534 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK6Q00534 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK6Q00534 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK6Q00534 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK6Q00534 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK6Q00534 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK6Q00534 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CDK6Q00534 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK6Q00534 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK6Q00534 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK6Q00534 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK6Q00534 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK6Q00534 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK6Q00534 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK6Q00534 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK6Q00534 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK6Q00534 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK6Q00534 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK6Q00534 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK6Q00534 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK6Q00534 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK6Q00534 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK6Q00534 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK6Q00534 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK6Q00534 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK6Q00534 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK6Q00534 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK6Q00534 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CDK6Q00534 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK6Q00534 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms