Protein–RNA interactions for Protein: P78385

KRT83, Keratin, type II cuticular Hb3, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT83P78385 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT83P78385 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT83P78385 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT83P78385 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT83P78385 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT83P78385 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT83P78385 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT83P78385 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT83P78385 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT83P78385 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT83P78385 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT83P78385 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT83P78385 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT83P78385 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT83P78385 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT83P78385 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT83P78385 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT83P78385 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT83P78385 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT83P78385 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT83P78385 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT83P78385 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT83P78385 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT83P78385 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT83P78385 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT83P78385 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT83P78385 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT83P78385 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT83P78385 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT83P78385 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT83P78385 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT83P78385 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT83P78385 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT83P78385 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT83P78385 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT83P78385 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KRT83P78385 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KRT83P78385 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT83P78385 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT83P78385 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT83P78385 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT83P78385 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT83P78385 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT83P78385 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT83P78385 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT83P78385 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT83P78385 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT83P78385 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT83P78385 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT83P78385 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT83P78385 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT83P78385 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT83P78385 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT83P78385 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT83P78385 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT83P78385 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT83P78385 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT83P78385 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT83P78385 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT83P78385 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT83P78385 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT83P78385 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT83P78385 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT83P78385 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT83P78385 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT83P78385 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT83P78385 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT83P78385 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT83P78385 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT83P78385 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT83P78385 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT83P78385 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT83P78385 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT83P78385 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT83P78385 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT83P78385 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT83P78385 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT83P78385 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT83P78385 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT83P78385 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT83P78385 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT83P78385 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT83P78385 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT83P78385 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT83P78385 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT83P78385 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT83P78385 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT83P78385 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT83P78385 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT83P78385 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT83P78385 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT83P78385 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT83P78385 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT83P78385 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT83P78385 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT83P78385 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT83P78385 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT83P78385 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT83P78385 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT83P78385 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms