Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPC5P78333 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPC5P78333 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPC5P78333 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPC5P78333 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPC5P78333 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPC5P78333 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPC5P78333 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPC5P78333 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GPC5P78333 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPC5P78333 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPC5P78333 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPC5P78333 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPC5P78333 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPC5P78333 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPC5P78333 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPC5P78333 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPC5P78333 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GPC5P78333 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPC5P78333 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPC5P78333 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPC5P78333 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPC5P78333 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPC5P78333 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPC5P78333 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPC5P78333 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPC5P78333 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPC5P78333 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPC5P78333 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPC5P78333 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPC5P78333 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPC5P78333 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPC5P78333 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPC5P78333 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPC5P78333 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPC5P78333 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPC5P78333 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPC5P78333 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPC5P78333 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPC5P78333 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPC5P78333 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPC5P78333 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GPC5P78333 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPC5P78333 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPC5P78333 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPC5P78333 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPC5P78333 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPC5P78333 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPC5P78333 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPC5P78333 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPC5P78333 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPC5P78333 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPC5P78333 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPC5P78333 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPC5P78333 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPC5P78333 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPC5P78333 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GPC5P78333 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPC5P78333 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GPC5P78333 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPC5P78333 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPC5P78333 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPC5P78333 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPC5P78333 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPC5P78333 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPC5P78333 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPC5P78333 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPC5P78333 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPC5P78333 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPC5P78333 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPC5P78333 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPC5P78333 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPC5P78333 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GPC5P78333 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GPC5P78333 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GPC5P78333 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GPC5P78333 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GPC5P78333 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPC5P78333 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPC5P78333 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPC5P78333 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPC5P78333 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPC5P78333 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPC5P78333 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPC5P78333 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPC5P78333 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPC5P78333 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPC5P78333 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPC5P78333 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPC5P78333 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPC5P78333 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPC5P78333 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GPC5P78333 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPC5P78333 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPC5P78333 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPC5P78333 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPC5P78333 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GPC5P78333 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GPC5P78333 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPC5P78333 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms