Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVPABLB-1P60509 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVPABLB-1P60509 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVPABLB-1P60509 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVPABLB-1P60509 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVPABLB-1P60509 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVPABLB-1P60509 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVPABLB-1P60509 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVPABLB-1P60509 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVPABLB-1P60509 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVPABLB-1P60509 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVPABLB-1P60509 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVPABLB-1P60509 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVPABLB-1P60509 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVPABLB-1P60509 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVPABLB-1P60509 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVPABLB-1P60509 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVPABLB-1P60509 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVPABLB-1P60509 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVPABLB-1P60509 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVPABLB-1P60509 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVPABLB-1P60509 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVPABLB-1P60509 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVPABLB-1P60509 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVPABLB-1P60509 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVPABLB-1P60509 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVPABLB-1P60509 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVPABLB-1P60509 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVPABLB-1P60509 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVPABLB-1P60509 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVPABLB-1P60509 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVPABLB-1P60509 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVPABLB-1P60509 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVPABLB-1P60509 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVPABLB-1P60509 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVPABLB-1P60509 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVPABLB-1P60509 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVPABLB-1P60509 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVPABLB-1P60509 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ERVPABLB-1P60509 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ERVPABLB-1P60509 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms