Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
EEFSECP57772 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms