Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms