Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHB1P54762 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHB1P54762 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHB1P54762 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHB1P54762 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHB1P54762 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHB1P54762 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHB1P54762 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHB1P54762 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHB1P54762 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHB1P54762 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHB1P54762 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHB1P54762 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHB1P54762 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
EPHB1P54762 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHB1P54762 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHB1P54762 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHB1P54762 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHB1P54762 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHB1P54762 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHB1P54762 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHB1P54762 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHB1P54762 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHB1P54762 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHB1P54762 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHB1P54762 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHB1P54762 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHB1P54762 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHB1P54762 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHB1P54762 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHB1P54762 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHB1P54762 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHB1P54762 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHB1P54762 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB1P54762 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB1P54762 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB1P54762 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB1P54762 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB1P54762 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB1P54762 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB1P54762 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB1P54762 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB1P54762 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB1P54762 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB1P54762 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB1P54762 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB1P54762 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB1P54762 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHB1P54762 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHB1P54762 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHB1P54762 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHB1P54762 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHB1P54762 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHB1P54762 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHB1P54762 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHB1P54762 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHB1P54762 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHB1P54762 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHB1P54762 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHB1P54762 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHB1P54762 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHB1P54762 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHB1P54762 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHB1P54762 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHB1P54762 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHB1P54762 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHB1P54762 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms