Protein–RNA interactions for Protein: P53618

COPB1, Coatomer subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB1P53618 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COPB1P53618 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COPB1P53618 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COPB1P53618 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COPB1P53618 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COPB1P53618 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COPB1P53618 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COPB1P53618 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COPB1P53618 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
COPB1P53618 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
COPB1P53618 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
COPB1P53618 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
COPB1P53618 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COPB1P53618 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COPB1P53618 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COPB1P53618 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COPB1P53618 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COPB1P53618 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COPB1P53618 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COPB1P53618 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COPB1P53618 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COPB1P53618 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPB1P53618 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPB1P53618 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPB1P53618 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPB1P53618 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPB1P53618 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPB1P53618 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPB1P53618 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPB1P53618 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPB1P53618 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPB1P53618 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPB1P53618 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPB1P53618 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPB1P53618 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COPB1P53618 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COPB1P53618 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COPB1P53618 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COPB1P53618 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COPB1P53618 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COPB1P53618 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
COPB1P53618 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COPB1P53618 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COPB1P53618 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COPB1P53618 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COPB1P53618 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
COPB1P53618 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COPB1P53618 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COPB1P53618 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COPB1P53618 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
COPB1P53618 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COPB1P53618 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COPB1P53618 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COPB1P53618 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COPB1P53618 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
COPB1P53618 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
COPB1P53618 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COPB1P53618 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COPB1P53618 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
COPB1P53618 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPB1P53618 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPB1P53618 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPB1P53618 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPB1P53618 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPB1P53618 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPB1P53618 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPB1P53618 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPB1P53618 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COPB1P53618 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COPB1P53618 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COPB1P53618 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
COPB1P53618 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COPB1P53618 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COPB1P53618 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COPB1P53618 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COPB1P53618 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COPB1P53618 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COPB1P53618 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COPB1P53618 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
COPB1P53618 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COPB1P53618 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COPB1P53618 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COPB1P53618 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COPB1P53618 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COPB1P53618 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COPB1P53618 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COPB1P53618 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COPB1P53618 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COPB1P53618 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COPB1P53618 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COPB1P53618 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COPB1P53618 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COPB1P53618 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COPB1P53618 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COPB1P53618 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COPB1P53618 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COPB1P53618 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPB1P53618 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPB1P53618 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPB1P53618 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms