Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TGFBR1P36897 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TGFBR1P36897 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TGFBR1P36897 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TGFBR1P36897 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TGFBR1P36897 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TGFBR1P36897 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TGFBR1P36897 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TGFBR1P36897 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TGFBR1P36897 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TGFBR1P36897 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TGFBR1P36897 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TGFBR1P36897 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TGFBR1P36897 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TGFBR1P36897 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TGFBR1P36897 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TGFBR1P36897 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TGFBR1P36897 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TGFBR1P36897 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TGFBR1P36897 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TGFBR1P36897 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TGFBR1P36897 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TGFBR1P36897 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TGFBR1P36897 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TGFBR1P36897 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TGFBR1P36897 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TGFBR1P36897 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TGFBR1P36897 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TGFBR1P36897 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TGFBR1P36897 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TGFBR1P36897 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TGFBR1P36897 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TGFBR1P36897 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TGFBR1P36897 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TGFBR1P36897 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TGFBR1P36897 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TGFBR1P36897 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TGFBR1P36897 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TGFBR1P36897 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TGFBR1P36897 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TGFBR1P36897 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms