Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms