Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXA13P31271 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXA13P31271 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXA13P31271 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXA13P31271 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXA13P31271 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXA13P31271 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXA13P31271 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXA13P31271 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXA13P31271 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXA13P31271 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXA13P31271 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXA13P31271 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXA13P31271 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXA13P31271 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXA13P31271 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXA13P31271 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXA13P31271 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXA13P31271 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXA13P31271 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXA13P31271 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXA13P31271 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXA13P31271 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXA13P31271 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HOXA13P31271 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXA13P31271 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXA13P31271 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXA13P31271 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXA13P31271 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXA13P31271 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXA13P31271 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXA13P31271 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXA13P31271 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXA13P31271 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXA13P31271 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXA13P31271 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXA13P31271 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXA13P31271 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXA13P31271 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXA13P31271 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXA13P31271 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXA13P31271 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXA13P31271 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXA13P31271 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXA13P31271 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXA13P31271 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXA13P31271 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXA13P31271 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXA13P31271 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXA13P31271 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXA13P31271 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXA13P31271 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXA13P31271 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXA13P31271 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXA13P31271 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXA13P31271 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXA13P31271 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXA13P31271 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXA13P31271 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXA13P31271 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXA13P31271 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXA13P31271 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXA13P31271 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXA13P31271 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXA13P31271 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXA13P31271 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXA13P31271 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HOXA13P31271 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HOXA13P31271 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXA13P31271 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXA13P31271 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXA13P31271 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXA13P31271 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXA13P31271 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXA13P31271 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXA13P31271 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXA13P31271 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXA13P31271 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXA13P31271 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXA13P31271 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXA13P31271 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA13P31271 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA13P31271 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA13P31271 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA13P31271 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA13P31271 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA13P31271 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA13P31271 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA13P31271 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA13P31271 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA13P31271 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA13P31271 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXA13P31271 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXA13P31271 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXA13P31271 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXA13P31271 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXA13P31271 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXA13P31271 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXA13P31271 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXA13P31271 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms