Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms