Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VARSP26640 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VARSP26640 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VARSP26640 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VARSP26640 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VARSP26640 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VARSP26640 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VARSP26640 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VARSP26640 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VARSP26640 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VARSP26640 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VARSP26640 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VARSP26640 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VARSP26640 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VARSP26640 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VARSP26640 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VARSP26640 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VARSP26640 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VARSP26640 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VARSP26640 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VARSP26640 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VARSP26640 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VARSP26640 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VARSP26640 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VARSP26640 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VARSP26640 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VARSP26640 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VARSP26640 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VARSP26640 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VARSP26640 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VARSP26640 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VARSP26640 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VARSP26640 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VARSP26640 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VARSP26640 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VARSP26640 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VARSP26640 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VARSP26640 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VARSP26640 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VARSP26640 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VARSP26640 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VARSP26640 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VARSP26640 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VARSP26640 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VARSP26640 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VARSP26640 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VARSP26640 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VARSP26640 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VARSP26640 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VARSP26640 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VARSP26640 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VARSP26640 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VARSP26640 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VARSP26640 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VARSP26640 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VARSP26640 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VARSP26640 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VARSP26640 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VARSP26640 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VARSP26640 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VARSP26640 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VARSP26640 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VARSP26640 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VARSP26640 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VARSP26640 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VARSP26640 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VARSP26640 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VARSP26640 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VARSP26640 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VARSP26640 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VARSP26640 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VARSP26640 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VARSP26640 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VARSP26640 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VARSP26640 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VARSP26640 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VARSP26640 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VARSP26640 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VARSP26640 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VARSP26640 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VARSP26640 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VARSP26640 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VARSP26640 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VARSP26640 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VARSP26640 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VARSP26640 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VARSP26640 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VARSP26640 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VARSP26640 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VARSP26640 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VARSP26640 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VARSP26640 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VARSP26640 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VARSP26640 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VARSP26640 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VARSP26640 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VARSP26640 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VARSP26640 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VARSP26640 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VARSP26640 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms