Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPREP23469 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPREP23469 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPREP23469 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPREP23469 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPREP23469 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPREP23469 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPREP23469 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPREP23469 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPREP23469 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPREP23469 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPREP23469 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPREP23469 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPREP23469 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPREP23469 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPREP23469 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPREP23469 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPREP23469 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPREP23469 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPREP23469 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPREP23469 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPREP23469 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPREP23469 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPREP23469 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPREP23469 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPREP23469 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPREP23469 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPREP23469 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPREP23469 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPREP23469 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPREP23469 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPREP23469 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPREP23469 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPREP23469 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPREP23469 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPREP23469 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPREP23469 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPREP23469 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPREP23469 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPREP23469 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPREP23469 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPREP23469 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPREP23469 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPREP23469 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPREP23469 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPREP23469 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPREP23469 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPREP23469 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPREP23469 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPREP23469 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPREP23469 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPREP23469 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPREP23469 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPREP23469 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPREP23469 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPREP23469 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPREP23469 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPREP23469 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPREP23469 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPREP23469 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPREP23469 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPREP23469 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPREP23469 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPREP23469 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPREP23469 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPREP23469 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPREP23469 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPREP23469 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPREP23469 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPREP23469 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPREP23469 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPREP23469 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPREP23469 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPREP23469 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPREP23469 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPREP23469 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPREP23469 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPREP23469 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPREP23469 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPREP23469 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPREP23469 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPREP23469 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPREP23469 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPREP23469 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPREP23469 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPREP23469 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPREP23469 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPREP23469 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPREP23469 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPREP23469 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPREP23469 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPREP23469 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPREP23469 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPREP23469 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPREP23469 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPREP23469 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPREP23469 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPREP23469 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPREP23469 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPREP23469 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms