Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.12e-8■■■■■ 35
RPS3P23396 COG8-205ENST00000615447 426 nt21.34■■□□□ 1.012e-8■■■■■ 35
RPS3P23396 AC026464.1-201ENST00000570293 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 28.16□□□□□ -1.12e-8■■■■■ 35
RPS3P23396 AC026464.1-202ENST00000564737 722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.192e-8■■■■■ 35
RPS3P23396 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.552e-8■■■■■ 35
RPS3P23396 SSR4-209ENST00000482902 2409 ntTSL 217.57■□□□□ 0.45e-7■■■■■ 35
RPS3P23396 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.295e-7■■■■■ 35
RPS3P23396 SSR4-206ENST00000460616 2482 ntTSL 214.83□□□□□ -0.045e-7■■■■■ 35
RPS3P23396 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.095e-7■■■■■ 35
RPS3P23396 SSR4-208ENST00000471880 785 ntTSL 514.34□□□□□ -0.115e-7■■■■■ 35
RPS3P23396 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.165e-7■■■■■ 35
RPS3P23396 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.255e-7■■■■■ 35
RPS3P23396 APOE-203ENST00000434152 864 ntTSL 219.86■□□□□ 0.774e-53■■■■■ 35
RPS3P23396 PCK2-204ENST00000557969 525 ntTSL 215.88■□□□□ 0.134e-20■■■■■ 35
RPS3P23396 INSR-202ENST00000341500 8954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.924e-10■■■■■ 35
RPS3P23396 VAT1-204ENST00000587147 582 ntTSL 216.57■□□□□ 0.243e-9■■■■■ 34.9
RPS3P23396 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.652e-7■■■■■ 34.9
RPS3P23396 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.122e-7■■■■■ 34.9
RPS3P23396 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.232e-7■■■■■ 34.9
RPS3P23396 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.262e-7■■■■■ 34.9
RPS3P23396 TMEM9-210ENST00000495205 971 ntTSL 512.8□□□□□ -0.362e-7■■■■■ 34.9
RPS3P23396 TMEM9-208ENST00000472411 2892 ntTSL 210.35□□□□□ -0.757e-13■■■■■ 34.9
RPS3P23396 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.017e-7■■■■■ 34.9
RPS3P23396 VTN-202ENST00000539746 609 ntTSL 211.75□□□□□ -0.535e-15■■■■■ 34.9
RPS3P23396 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC13.64□□□□□ -0.238e-32■■■■■ 34.9
RPS3P23396 SNORD3B-1-203ENST00000631292 217 nt11.06□□□□□ -0.648e-32■■■■■ 34.9
RPS3P23396 SNORD3B-1-202ENST00000617128 218 nt10.93□□□□□ -0.668e-32■■■■■ 34.9
RPS3P23396 ATP5A1-208ENST00000589252 662 ntTSL 518.79■□□□□ 0.62e-9■■■■■ 34.8
RPS3P23396 MIDN-202ENST00000586757 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 523.7■■□□□ 1.381e-8■■■■■ 34.8
RPS3P23396 C14orf2-210ENST00000555030 749 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.831e-10■■■■■ 34.8
RPS3P23396 C14orf2-201ENST00000286953 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.021e-10■■■■■ 34.8
RPS3P23396 C14orf2-203ENST00000553430 1659 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.081e-10■■■■■ 34.8
RPS3P23396 C14orf2-202ENST00000414262 842 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.161e-10■■■■■ 34.8
RPS3P23396 C14orf2-204ENST00000553449 271 ntTSL 27.47□□□□□ -1.211e-10■■■■■ 34.8
RPS3P23396 C14orf2-209ENST00000554880 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.261e-10■■■■■ 34.8
RPS3P23396 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.81e-10■■■■■ 34.8
RPS3P23396 TK1-202ENST00000586613 631 ntTSL 316.72■□□□□ 0.274e-7■■■■■ 34.7
RPS3P23396 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.073e-10■■■■■ 34.7
RPS3P23396 NDUFS8-205ENST00000525419 561 ntTSL 320.46■□□□□ 0.874e-10■■■■■ 34.7
RPS3P23396 NDUFS8-208ENST00000526446 814 ntTSL 517.11■□□□□ 0.334e-10■■■■■ 34.7
RPS3P23396 NDUFS8-202ENST00000432321 936 ntTSL 215.76■□□□□ 0.114e-10■■■■■ 34.7
RPS3P23396 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.114e-10■■■■■ 34.7
RPS3P23396 NDUFS8-203ENST00000453471 620 ntTSL 315.39■□□□□ 0.054e-10■■■■■ 34.7
RPS3P23396 NDUFS8-206ENST00000525628 515 ntTSL 214.84□□□□□ -0.034e-10■■■■■ 34.7
RPS3P23396 NDUFS8-212ENST00000531228 531 ntTSL 214.53□□□□□ -0.084e-10■■■■■ 34.7
RPS3P23396 NDUFS8-215ENST00000532399 3072 ntTSL 213.29□□□□□ -0.284e-10■■■■■ 34.7
RPS3P23396 NDUFS8-207ENST00000526339 689 ntTSL 213.05□□□□□ -0.324e-10■■■■■ 34.7
RPS3P23396 NDUFS8-211ENST00000529645 606 ntTSL 311.51□□□□□ -0.574e-10■■■■■ 34.7
RPS3P23396 NDUFS8-210ENST00000528492 353 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.614e-10■■■■■ 34.7
RPS3P23396 SERPINC1-201ENST00000367698 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.939e-7■■■■■ 34.7
RPS3P23396 SERPINC1-204ENST00000617423 984 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.129e-7■■■■■ 34.7
RPS3P23396 COMT-207ENST00000412786 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 215.7■□□□□ 0.15e-10■■■■■ 34.7
RPS3P23396 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.674e-6■■■■■ 34.7
RPS3P23396 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.624e-6■■■■■ 34.7
RPS3P23396 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.614e-6■■■■■ 34.7
RPS3P23396 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.574e-6■■■■■ 34.7
RPS3P23396 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.564e-6■■■■■ 34.7
RPS3P23396 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.544e-6■■■■■ 34.7
RPS3P23396 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.434e-6■■■■■ 34.7
RPS3P23396 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.024e-6■■■■■ 34.7
RPS3P23396 G6PC-203ENST00000588481 604 ntTSL 27.64□□□□□ -1.194e-9■■■■■ 34.7
RPS3P23396 CTSD-203ENST00000429746 690 ntTSL 317.01■□□□□ 0.314e-22■■■■■ 34.6
RPS3P23396 MCM4-202ENST00000517709 842 ntTSL 211.46□□□□□ -0.574e-8■■■■■ 34.6
RPS3P23396 MCM4-205ENST00000518680 862 ntTSL 511.35□□□□□ -0.594e-8■■■■■ 34.6
RPS3P23396 UPF1-213ENST00000601981 556 ntTSL 59.88□□□□□ -0.833e-7■■■■■ 34.6
RPS3P23396 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.148e-25■■■■■ 34.6
RPS3P23396 PRNP-204ENST00000457586 855 ntTSL 1 (best)22.82■■□□□ 1.245e-7■■■■■ 34.6
RPS3P23396 PRNP-202ENST00000424424 806 ntTSL 1 (best)18.21■□□□□ 0.515e-7■■■■■ 34.6
RPS3P23396 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.065e-7■■■■■ 34.6
RPS3P23396 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.075e-7■■■■■ 34.6
RPS3P23396 CTNNA1-206ENST00000517980 696 ntTSL 416.55■□□□□ 0.244e-7■■■■■ 34.6
RPS3P23396 PNP-201ENST00000361505 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.423e-10■■■■■ 34.6
RPS3P23396 PNP-204ENST00000554056 1635 ntTSL 510.58□□□□□ -0.723e-10■■■■■ 34.6
RPS3P23396 HP-208ENST00000564499 695 ntTSL 37.35□□□□□ -1.233e-7■■■■■ 34.6
RPS3P23396 PCCB-206ENST00000465423 582 ntTSL 414.27□□□□□ -0.133e-9■■■■■ 34.6
RPS3P23396 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.333e-7■■■■■ 34.6
RPS3P23396 DDX18-205ENST00000476149 5674 ntTSL 25.2□□□□□ -1.583e-7■■■■■ 34.6
RPS3P23396 DDX18-202ENST00000415038 644 ntTSL 53.56□□□□□ -1.843e-7■■■■■ 34.6
RPS3P23396 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.422e-6■■■■■ 34.5
RPS3P23396 DHRS7B-203ENST00000577350 744 ntTSL 1 (best)17.43■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 34.5
RPS3P23396 DHRS7B-201ENST00000346603 1567 ntTSL 1 (best)16.6■□□□□ 0.252e-6■■■■■ 34.5
RPS3P23396 DHRS7B-204ENST00000578426 998 ntTSL 314.72□□□□□ -0.052e-6■■■■■ 34.5
RPS3P23396 DHRS7B-205ENST00000579099 444 ntTSL 214.13□□□□□ -0.152e-6■■■■■ 34.5
RPS3P23396 DHRS7B-209ENST00000582161 767 ntTSL 313.51□□□□□ -0.252e-6■■■■■ 34.5
RPS3P23396 DHRS7B-202ENST00000395511 2175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 34.5
RPS3P23396 TMBIM6-204ENST00000546796 556 ntTSL 57.54□□□□□ -1.29e-9■■■■■ 34.5
RPS3P23396 TMBIM6-211ENST00000548201 582 ntTSL 47.41□□□□□ -1.229e-9■■■■■ 34.5
RPS3P23396 TMBIM6-210ENST00000547832 640 ntTSL 36.1□□□□□ -1.439e-9■■■■■ 34.5
RPS3P23396 MPDU1-208ENST00000571877 1195 ntTSL 1 (best)13.74□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 34.5
RPS3P23396 ITPRIPL2-202ENST00000566735 2008 ntTSL 218.01■□□□□ 0.471e-6■■■■■ 34.5
RPS3P23396 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.471e-6■■■■■ 34.5
RPS3P23396 AC099518.3-202ENST00000568526 365 ntAPPRIS ALT2 TSL 516.09■□□□□ 0.171e-6■■■■■ 34.5
RPS3P23396 TMBIM6-222ENST00000550445 761 ntTSL 311.27□□□□□ -0.619e-9■■■■■ 34.5
RPS3P23396 CLSTN3-204ENST00000535313 787 ntTSL 215.58■□□□□ 0.085e-8■■■■■ 34.4
RPS3P23396 CKB-211ENST00000555039 270 ntTSL 514.43□□□□□ -0.12e-8■■■■■ 34.4
RPS3P23396 NME1-205ENST00000465188 521 ntTSL 29.55□□□□□ -0.882e-31■■■■■ 34.4
RPS3P23396 NME1-204ENST00000456492 510 ntTSL 24.59□□□□□ -1.672e-31■■■■■ 34.4
RPS3P23396 PSMB7-201ENST00000259457 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.842e-7■■■■■ 34.3
RPS3P23396 HPX-204ENST00000527556 1126 ntTSL 213.49□□□□□ -0.254e-7■■■■■ 34.3
RPS3P23396 HPX-211ENST00000534429 486 ntTSL 311.89□□□□□ -0.514e-7■■■■■ 34.3
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