Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSMB1P20618 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSMB1P20618 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMB1P20618 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMB1P20618 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMB1P20618 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMB1P20618 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMB1P20618 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMB1P20618 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMB1P20618 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMB1P20618 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMB1P20618 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMB1P20618 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMB1P20618 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMB1P20618 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMB1P20618 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMB1P20618 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB1P20618 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms