Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP2B1P20020 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP2B1P20020 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP2B1P20020 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP2B1P20020 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP2B1P20020 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP2B1P20020 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP2B1P20020 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP2B1P20020 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP2B1P20020 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP2B1P20020 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP2B1P20020 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP2B1P20020 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP2B1P20020 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP2B1P20020 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP2B1P20020 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP2B1P20020 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP2B1P20020 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP2B1P20020 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP2B1P20020 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP2B1P20020 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP2B1P20020 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP2B1P20020 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP2B1P20020 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP2B1P20020 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP2B1P20020 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP2B1P20020 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATP2B1P20020 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATP2B1P20020 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATP2B1P20020 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATP2B1P20020 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP2B1P20020 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms