Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARF4P18085 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARF4P18085 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARF4P18085 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARF4P18085 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARF4P18085 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ARF4P18085 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARF4P18085 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARF4P18085 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARF4P18085 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARF4P18085 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARF4P18085 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARF4P18085 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ARF4P18085 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARF4P18085 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARF4P18085 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARF4P18085 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARF4P18085 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARF4P18085 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARF4P18085 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARF4P18085 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARF4P18085 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARF4P18085 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARF4P18085 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARF4P18085 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARF4P18085 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ARF4P18085 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARF4P18085 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARF4P18085 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
ARF4P18085 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARF4P18085 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ARF4P18085 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARF4P18085 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ARF4P18085 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ARF4P18085 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARF4P18085 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARF4P18085 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARF4P18085 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARF4P18085 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARF4P18085 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARF4P18085 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARF4P18085 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARF4P18085 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARF4P18085 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARF4P18085 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARF4P18085 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARF4P18085 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARF4P18085 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARF4P18085 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARF4P18085 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARF4P18085 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARF4P18085 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARF4P18085 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ARF4P18085 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ARF4P18085 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARF4P18085 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARF4P18085 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARF4P18085 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARF4P18085 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARF4P18085 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARF4P18085 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARF4P18085 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARF4P18085 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARF4P18085 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ARF4P18085 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ARF4P18085 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ARF4P18085 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ARF4P18085 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARF4P18085 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ARF4P18085 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARF4P18085 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARF4P18085 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARF4P18085 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARF4P18085 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARF4P18085 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARF4P18085 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARF4P18085 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARF4P18085 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARF4P18085 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARF4P18085 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARF4P18085 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARF4P18085 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARF4P18085 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ARF4P18085 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARF4P18085 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARF4P18085 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ARF4P18085 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARF4P18085 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARF4P18085 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARF4P18085 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARF4P18085 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ARF4P18085 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ARF4P18085 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARF4P18085 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARF4P18085 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARF4P18085 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARF4P18085 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARF4P18085 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARF4P18085 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARF4P18085 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms