Protein–RNA interactions for Protein: P17540

CKMT2, Creatine kinase S-type, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMT2P17540 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CKMT2P17540 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms