Protein–RNA interactions for Protein: P17509

HOXB6, Homeobox protein Hox-B6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB6P17509 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB6P17509 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB6P17509 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HOXB6P17509 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB6P17509 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB6P17509 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB6P17509 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB6P17509 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB6P17509 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXB6P17509 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXB6P17509 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXB6P17509 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXB6P17509 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXB6P17509 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXB6P17509 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXB6P17509 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms