Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOT1P17174 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOT1P17174 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOT1P17174 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GOT1P17174 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOT1P17174 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOT1P17174 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOT1P17174 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOT1P17174 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOT1P17174 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOT1P17174 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOT1P17174 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOT1P17174 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOT1P17174 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GOT1P17174 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOT1P17174 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOT1P17174 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOT1P17174 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOT1P17174 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOT1P17174 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOT1P17174 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOT1P17174 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOT1P17174 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOT1P17174 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOT1P17174 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOT1P17174 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOT1P17174 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOT1P17174 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOT1P17174 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOT1P17174 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOT1P17174 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GOT1P17174 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOT1P17174 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOT1P17174 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOT1P17174 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOT1P17174 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOT1P17174 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOT1P17174 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOT1P17174 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GOT1P17174 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOT1P17174 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOT1P17174 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOT1P17174 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOT1P17174 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOT1P17174 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOT1P17174 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOT1P17174 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOT1P17174 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOT1P17174 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOT1P17174 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOT1P17174 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOT1P17174 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOT1P17174 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOT1P17174 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOT1P17174 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOT1P17174 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOT1P17174 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOT1P17174 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOT1P17174 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOT1P17174 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOT1P17174 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOT1P17174 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOT1P17174 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOT1P17174 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOT1P17174 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOT1P17174 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOT1P17174 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOT1P17174 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOT1P17174 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOT1P17174 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOT1P17174 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOT1P17174 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOT1P17174 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOT1P17174 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GOT1P17174 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOT1P17174 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOT1P17174 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOT1P17174 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOT1P17174 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOT1P17174 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOT1P17174 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOT1P17174 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GOT1P17174 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOT1P17174 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOT1P17174 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOT1P17174 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOT1P17174 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOT1P17174 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOT1P17174 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOT1P17174 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOT1P17174 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOT1P17174 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOT1P17174 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOT1P17174 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOT1P17174 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOT1P17174 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GOT1P17174 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GOT1P17174 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOT1P17174 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GOT1P17174 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms