Protein–RNA interactions for Protein: P16035

TIMP2, Metalloproteinase inhibitor 2, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP2P16035 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIMP2P16035 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIMP2P16035 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIMP2P16035 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIMP2P16035 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIMP2P16035 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIMP2P16035 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TIMP2P16035 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TIMP2P16035 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TIMP2P16035 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TIMP2P16035 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TIMP2P16035 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TIMP2P16035 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TIMP2P16035 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TIMP2P16035 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TIMP2P16035 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIMP2P16035 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIMP2P16035 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIMP2P16035 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIMP2P16035 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIMP2P16035 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIMP2P16035 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIMP2P16035 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
TIMP2P16035 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TIMP2P16035 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TIMP2P16035 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TIMP2P16035 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TIMP2P16035 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TIMP2P16035 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TIMP2P16035 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TIMP2P16035 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TIMP2P16035 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TIMP2P16035 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TIMP2P16035 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TIMP2P16035 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TIMP2P16035 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TIMP2P16035 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TIMP2P16035 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TIMP2P16035 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TIMP2P16035 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms