Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFHP12036 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFHP12036 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFHP12036 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFHP12036 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFHP12036 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFHP12036 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFHP12036 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFHP12036 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFHP12036 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFHP12036 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFHP12036 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFHP12036 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFHP12036 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFHP12036 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFHP12036 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFHP12036 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFHP12036 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFHP12036 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFHP12036 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFHP12036 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFHP12036 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFHP12036 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFHP12036 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFHP12036 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFHP12036 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFHP12036 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFHP12036 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFHP12036 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFHP12036 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFHP12036 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFHP12036 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFHP12036 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFHP12036 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFHP12036 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFHP12036 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFHP12036 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFHP12036 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFHP12036 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFHP12036 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFHP12036 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFHP12036 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFHP12036 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFHP12036 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFHP12036 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFHP12036 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFHP12036 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEFHP12036 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEFHP12036 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NEFHP12036 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEFHP12036 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEFHP12036 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFHP12036 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFHP12036 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFHP12036 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFHP12036 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFHP12036 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFHP12036 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFHP12036 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFHP12036 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFHP12036 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFHP12036 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFHP12036 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFHP12036 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFHP12036 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFHP12036 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFHP12036 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFHP12036 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFHP12036 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFHP12036 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFHP12036 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFHP12036 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFHP12036 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFHP12036 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFHP12036 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFHP12036 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFHP12036 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFHP12036 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFHP12036 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFHP12036 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFHP12036 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFHP12036 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFHP12036 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFHP12036 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFHP12036 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFHP12036 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFHP12036 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFHP12036 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFHP12036 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFHP12036 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFHP12036 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFHP12036 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFHP12036 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
NEFHP12036 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NEFHP12036 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEFHP12036 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEFHP12036 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEFHP12036 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEFHP12036 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEFHP12036 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms