Protein–RNA interactions for Protein: P11802

CDK4, Cyclin-dependent kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK4P11802 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK4P11802 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK4P11802 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK4P11802 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK4P11802 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK4P11802 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK4P11802 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK4P11802 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK4P11802 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK4P11802 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK4P11802 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK4P11802 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK4P11802 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK4P11802 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK4P11802 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK4P11802 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK4P11802 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK4P11802 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK4P11802 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK4P11802 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK4P11802 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK4P11802 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK4P11802 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK4P11802 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK4P11802 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK4P11802 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK4P11802 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK4P11802 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK4P11802 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK4P11802 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK4P11802 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK4P11802 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK4P11802 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK4P11802 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK4P11802 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK4P11802 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK4P11802 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK4P11802 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK4P11802 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK4P11802 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK4P11802 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK4P11802 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK4P11802 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK4P11802 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK4P11802 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK4P11802 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK4P11802 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK4P11802 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK4P11802 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK4P11802 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK4P11802 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK4P11802 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK4P11802 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK4P11802 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK4P11802 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK4P11802 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK4P11802 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK4P11802 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK4P11802 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK4P11802 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK4P11802 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK4P11802 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK4P11802 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK4P11802 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK4P11802 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK4P11802 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK4P11802 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK4P11802 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK4P11802 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK4P11802 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK4P11802 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK4P11802 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK4P11802 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK4P11802 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK4P11802 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK4P11802 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK4P11802 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK4P11802 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK4P11802 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK4P11802 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK4P11802 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK4P11802 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK4P11802 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK4P11802 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK4P11802 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK4P11802 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK4P11802 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK4P11802 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK4P11802 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK4P11802 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK4P11802 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK4P11802 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK4P11802 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK4P11802 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK4P11802 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK4P11802 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK4P11802 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK4P11802 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK4P11802 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK4P11802 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms