Protein–RNA interactions for Protein: P0C264

SBK3, Uncharacterized serine/threonine-protein kinase SBK3, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK3P0C264 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SBK3P0C264 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SBK3P0C264 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SBK3P0C264 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SBK3P0C264 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SBK3P0C264 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SBK3P0C264 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SBK3P0C264 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SBK3P0C264 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SBK3P0C264 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SBK3P0C264 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SBK3P0C264 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SBK3P0C264 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SBK3P0C264 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SBK3P0C264 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SBK3P0C264 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SBK3P0C264 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SBK3P0C264 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SBK3P0C264 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SBK3P0C264 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SBK3P0C264 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SBK3P0C264 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SBK3P0C264 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SBK3P0C264 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SBK3P0C264 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SBK3P0C264 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SBK3P0C264 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SBK3P0C264 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SBK3P0C264 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SBK3P0C264 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SBK3P0C264 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SBK3P0C264 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SBK3P0C264 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SBK3P0C264 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SBK3P0C264 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SBK3P0C264 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SBK3P0C264 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SBK3P0C264 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SBK3P0C264 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SBK3P0C264 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SBK3P0C264 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBK3P0C264 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBK3P0C264 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBK3P0C264 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBK3P0C264 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBK3P0C264 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBK3P0C264 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBK3P0C264 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBK3P0C264 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBK3P0C264 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBK3P0C264 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SBK3P0C264 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SBK3P0C264 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms