Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms