Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 FDXR-210ENST00000579543 558 ntTSL 419.47■□□□□ 0.715e-6■■■■■ 197.5
SF3B1O75533 FDXR-213ENST00000581219 567 ntTSL 418.35■□□□□ 0.535e-6■■■■■ 197.5
SF3B1O75533 MAP4K2-207ENST00000444560 469 ntTSL 525.34■■□□□ 1.653e-7■■■■■ 197.4
SF3B1O75533 MAP4K2-206ENST00000439069 947 ntTSL 321.6■■□□□ 1.053e-7■■■■■ 197.4
SF3B1O75533 MAP4K2-204ENST00000433890 2410 ntTSL 519.96■□□□□ 0.793e-7■■■■■ 197.4
SF3B1O75533 MAP4K2-209ENST00000468062 818 ntTSL 518.35■□□□□ 0.533e-7■■■■■ 197.4
SF3B1O75533 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.443e-7■■■■■ 197.4
SF3B1O75533 MAP4K2-205ENST00000435926 3169 ntTSL 516.1■□□□□ 0.173e-7■■■■■ 197.4
SF3B1O75533 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.283e-7■■■■■ 197.4
SF3B1O75533 MAP4K2-211ENST00000482314 579 ntTSL 311.05□□□□□ -0.643e-7■■■■■ 197.4
SF3B1O75533 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.011e-6■■■■■ 197.2
SF3B1O75533 INMT-MINDY4-202ENST00000458257 2877 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.491e-6■■■■■ 197.2
SF3B1O75533 RBM20-201ENST00000369519 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 197.1
SF3B1O75533 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.232e-9■■■■■ 197
SF3B1O75533 NDRG1-219ENST00000521544 709 ntTSL 514.28□□□□□ -0.123e-10■■■■■ 197
SF3B1O75533 NDRG1-215ENST00000520943 536 ntTSL 411.1□□□□□ -0.633e-10■■■■■ 197
SF3B1O75533 RAD54L2-203ENST00000461680 5129 ntTSL 210.94□□□□□ -0.662e-9■■■■■ 197
SF3B1O75533 NDRG1-227ENST00000523892 562 ntTSL 49.66□□□□□ -0.863e-10■■■■■ 197
SF3B1O75533 CTDSPL-201ENST00000273179 4459 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.022e-9■■■■■ 197
SF3B1O75533 RAD54L2-202ENST00000432863 3926 ntTSL 27.51□□□□□ -1.212e-9■■■■■ 197
SF3B1O75533 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.763e-6■■■■■ 196.5
SF3B1O75533 ABHD2-205ENST00000565066 845 ntTSL 518.46■□□□□ 0.554e-6■■■■■ 196.5
SF3B1O75533 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.443e-6■■■■■ 196.5
SF3B1O75533 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.324e-6■■■■■ 196.5
SF3B1O75533 ABHD2-209ENST00000569411 558 ntTSL 512.61□□□□□ -0.394e-6■■■■■ 196.5
SF3B1O75533 ABHD2-201ENST00000352732 8735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.714e-6■■■■■ 196.5
SF3B1O75533 PBK-204ENST00000524266 819 ntTSL 57.78□□□□□ -1.163e-6■■■■■ 196.5
SF3B1O75533 PBK-202ENST00000521226 748 ntTSL 34.02□□□□□ -1.773e-6■■■■■ 196.5
SF3B1O75533 ARAP1-210ENST00000465814 5612 ntTSL 215.15■□□□□ 0.022e-6■■■■■ 196.3
SF3B1O75533 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.162e-6■■■■■ 196.3
SF3B1O75533 ARAP1-205ENST00000426523 4066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.582e-6■■■■■ 196.3
SF3B1O75533 ARAP1-207ENST00000429686 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.782e-6■■■■■ 196.3
SF3B1O75533 SCARB1-207ENST00000541661 476 ntTSL 514.51□□□□□ -0.092e-14■■■■■ 196.1
SF3B1O75533 SPON2-204ENST00000502483 571 ntTSL 427.1■■□□□ 1.932e-6■■■■■ 195.3
SF3B1O75533 SPON2-207ENST00000504871 581 ntTSL 426.54■■□□□ 1.842e-6■■■■■ 195.3
SF3B1O75533 SPON2-220ENST00000515004 571 ntTSL 424.44■■□□□ 1.52e-6■■■■■ 195.3
SF3B1O75533 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.352e-6■■■■■ 195.3
SF3B1O75533 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.344e-8■■■■■ 195.3
SF3B1O75533 MAP2K5-209ENST00000558392 1506 ntTSL 521.34■■□□□ 1.014e-8■■■■■ 195.3
SF3B1O75533 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.994e-8■■■■■ 195.3
SF3B1O75533 SPON2-212ENST00000509233 549 ntTSL 421.15■□□□□ 0.982e-6■■■■■ 195.3
SF3B1O75533 TBKBP1-203ENST00000578982 733 ntTSL 320.95■□□□□ 0.945e-9■■■■■ 195.3
SF3B1O75533 MAP2K5-208ENST00000558274 413 ntTSL 320.3■□□□□ 0.844e-8■■■■■ 195.3
SF3B1O75533 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.784e-8■■■■■ 195.3
SF3B1O75533 SPON2-215ENST00000511672 557 ntTSL 418.69■□□□□ 0.582e-6■■■■■ 195.3
SF3B1O75533 SPON2-216ENST00000511679 556 ntTSL 516.96■□□□□ 0.32e-6■■■■■ 195.3
SF3B1O75533 UXS1-210ENST00000473338 1547 ntTSL 1 (best)15.94■□□□□ 0.143e-10■■■■■ 195.3
SF3B1O75533 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.064e-8■■■■■ 195.3
SF3B1O75533 SPON2-210ENST00000506266 462 ntTSL 414.19□□□□□ -0.142e-6■■■■■ 195.3
SF3B1O75533 TMEM184B-205ENST00000436674 3667 ntTSL 1 (best)13.38□□□□□ -0.274e-8■■■■■ 195.3
SF3B1O75533 UBA6-AS1-205ENST00000506606 2233 ntTSL 29.19□□□□□ -0.947e-8■■■■■ 195.3
SF3B1O75533 UXS1-215ENST00000497604 2907 ntTSL 27.47□□□□□ -1.213e-10■■■■■ 195.3
SF3B1O75533 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.541e-6■■■■■ 194.9
SF3B1O75533 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.334e-6■■■■■ 194.4
SF3B1O75533 IFT140-202ENST00000397417 4023 ntTSL 511.4□□□□□ -0.584e-6■■■■■ 194.4
SF3B1O75533 NUDCD3-203ENST00000460110 3641 ntTSL 1 (best)9.62□□□□□ -0.878e-7■■■■■ 194
SF3B1O75533 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.661e-7■■■■■ 193.9
SF3B1O75533 ST3GAL1-202ENST00000517668 665 ntTSL 521.18■□□□□ 0.983e-6■■■■■ 193.9
SF3B1O75533 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.151e-7■■■■■ 193.9
SF3B1O75533 ST3GAL1-212ENST00000522873 613 ntTSL 313.45□□□□□ -0.263e-6■■■■■ 193.9
SF3B1O75533 ST3GAL1-211ENST00000522652 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.453e-6■■■■■ 193.9
SF3B1O75533 ST3GAL1-203ENST00000518298 921 ntTSL 1 (best)9.9□□□□□ -0.823e-6■■■■■ 193.9
SF3B1O75533 FNBP4-213ENST00000534003 2515 ntTSL 517.42■□□□□ 0.381e-6■■■■■ 193.9
SF3B1O75533 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.293e-7■■■■■ 193.4
SF3B1O75533 UNC13D-202ENST00000412096 3648 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.43e-7■■■■■ 193.4
SF3B1O75533 TET3-202ENST00000409262 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.851e-6■■■■■ 193.3
SF3B1O75533 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.274e-8■■■■■ 193
SF3B1O75533 SYNJ2-201ENST00000355585 7378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.634e-8■■■■■ 193
SF3B1O75533 FAF1-205ENST00000494400 2127 ntTSL 210.34□□□□□ -0.754e-8■■■■■ 193
SF3B1O75533 SREBF1-220ENST00000581707 695 ntTSL 221.34■■□□□ 1.012e-7■■■■■ 192.5
SF3B1O75533 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.435e-6■■■■■ 192.5
SF3B1O75533 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.352e-7■■■■■ 192.5
SF3B1O75533 ZC3H12A-204ENST00000640233 2721 ntTSL 516.26■□□□□ 0.192e-7■■■■■ 192.5
SF3B1O75533 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.265e-6■■■■■ 192.5
SF3B1O75533 RAB8B-201ENST00000321437 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 192.2
SF3B1O75533 RAB8B-202ENST00000558119 774 ntTSL 29.93□□□□□ -0.822e-6■■■■■ 192.2
SF3B1O75533 RAB8B-205ENST00000559927 755 ntTSL 57.28□□□□□ -1.242e-6■■■■■ 192.2
SF3B1O75533 RAB8B-203ENST00000558990 643 ntTSL 46.42□□□□□ -1.382e-6■■■■■ 192.2
SF3B1O75533 RAB8B-204ENST00000559006 584 ntTSL 25.79□□□□□ -1.482e-6■■■■■ 192.2
SF3B1O75533 NPRL3-208ENST00000473674 855 ntTSL 311.61□□□□□ -0.552e-6■■■■■ 191.7
SF3B1O75533 POT1-203ENST00000429326 579 ntTSL 52.84□□□□□ -1.969e-11■■■■■ 191.5
SF3B1O75533 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.651e-6■■■■■ 191.3
SF3B1O75533 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.151e-6■■■■■ 191.3
SF3B1O75533 PRKAR1B-206ENST00000417852 651 ntTSL 220.75■□□□□ 0.911e-6■■■■■ 191.3
SF3B1O75533 SC5D-209ENST00000534455 921 ntTSL 217.74■□□□□ 0.434e-6■■■■■ 191.3
SF3B1O75533 SC5D-205ENST00000527762 589 ntTSL 417.61■□□□□ 0.414e-6■■■■■ 191.3
SF3B1O75533 TMEM131-209ENST00000489507 568 ntTSL 317.13■□□□□ 0.334e-6■■■■■ 191.3
SF3B1O75533 SC5D-207ENST00000531140 767 ntTSL 1 (best)17.01■□□□□ 0.314e-6■■■■■ 191.3
SF3B1O75533 SMURF1-203ENST00000472627 825 ntTSL 215.58■□□□□ 0.086e-7■■■■■ 191.3
SF3B1O75533 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.014e-6■■■■■ 191.3
SF3B1O75533 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.014e-6■■■■■ 191.3
SF3B1O75533 IFT122-222ENST00000511425 2225 ntTSL 214.02□□□□□ -0.164e-6■■■■■ 191.3
SF3B1O75533 DHX29-202ENST00000504778 4557 ntTSL 1 (best)13.8□□□□□ -0.26e-7■■■■■ 191.3
SF3B1O75533 IFT122-204ENST00000349441 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.264e-6■■■■■ 191.3
SF3B1O75533 SC5D-208ENST00000534230 1861 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.294e-6■■■■■ 191.3
SF3B1O75533 AC087235.1-201ENST00000538297 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.54e-6■■■■■ 191.3
SF3B1O75533 DHX29-205ENST00000621106 4450 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.56e-7■■■■■ 191.3
SF3B1O75533 IFT122-213ENST00000506507 4532 ntTSL 511.52□□□□□ -0.574e-6■■■■■ 191.3
SF3B1O75533 INPP5A-201ENST00000342652 832 ntTSL 510.94□□□□□ -0.661e-7■■■■■ 191.3
SF3B1O75533 IFT122-203ENST00000348417 3877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.664e-6■■■■■ 191.3
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 291.4 ms