Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN11O75508 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN11O75508 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN11O75508 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN11O75508 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN11O75508 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN11O75508 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN11O75508 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN11O75508 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN11O75508 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN11O75508 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN11O75508 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN11O75508 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN11O75508 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN11O75508 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN11O75508 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN11O75508 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN11O75508 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN11O75508 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN11O75508 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN11O75508 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN11O75508 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN11O75508 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN11O75508 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN11O75508 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN11O75508 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN11O75508 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN11O75508 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN11O75508 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN11O75508 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN11O75508 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN11O75508 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN11O75508 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN11O75508 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN11O75508 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN11O75508 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN11O75508 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN11O75508 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN11O75508 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN11O75508 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN11O75508 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN11O75508 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN11O75508 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN11O75508 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN11O75508 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN11O75508 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN11O75508 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN11O75508 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLDN11O75508 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLDN11O75508 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms