Protein–RNA interactions for Protein: O75439

PMPCB, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMPCBO75439 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PMPCBO75439 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PMPCBO75439 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PMPCBO75439 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms