Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF40O75150 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF40O75150 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF40O75150 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF40O75150 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF40O75150 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF40O75150 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF40O75150 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF40O75150 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF40O75150 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF40O75150 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF40O75150 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF40O75150 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF40O75150 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF40O75150 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF40O75150 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF40O75150 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF40O75150 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF40O75150 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF40O75150 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF40O75150 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF40O75150 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF40O75150 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF40O75150 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF40O75150 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF40O75150 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF40O75150 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF40O75150 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF40O75150 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF40O75150 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF40O75150 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF40O75150 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF40O75150 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF40O75150 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF40O75150 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF40O75150 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF40O75150 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF40O75150 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF40O75150 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF40O75150 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF40O75150 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF40O75150 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF40O75150 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF40O75150 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF40O75150 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF40O75150 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF40O75150 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RNF40O75150 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RNF40O75150 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RNF40O75150 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RNF40O75150 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF40O75150 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF40O75150 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF40O75150 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF40O75150 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF40O75150 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF40O75150 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF40O75150 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF40O75150 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF40O75150 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF40O75150 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF40O75150 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF40O75150 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF40O75150 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF40O75150 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF40O75150 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF40O75150 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF40O75150 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF40O75150 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF40O75150 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF40O75150 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF40O75150 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF40O75150 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF40O75150 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF40O75150 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF40O75150 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF40O75150 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF40O75150 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF40O75150 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF40O75150 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF40O75150 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF40O75150 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF40O75150 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF40O75150 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF40O75150 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF40O75150 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF40O75150 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF40O75150 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF40O75150 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF40O75150 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF40O75150 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF40O75150 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF40O75150 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF40O75150 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF40O75150 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF40O75150 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF40O75150 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF40O75150 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF40O75150 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF40O75150 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms