Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTIFO43310 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTIFO43310 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTIFO43310 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTIFO43310 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTIFO43310 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTIFO43310 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTIFO43310 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTIFO43310 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTIFO43310 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTIFO43310 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTIFO43310 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTIFO43310 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTIFO43310 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTIFO43310 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTIFO43310 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTIFO43310 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTIFO43310 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTIFO43310 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTIFO43310 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTIFO43310 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTIFO43310 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTIFO43310 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTIFO43310 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTIFO43310 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CTIFO43310 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTIFO43310 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTIFO43310 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTIFO43310 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CTIFO43310 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTIFO43310 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTIFO43310 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTIFO43310 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTIFO43310 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTIFO43310 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTIFO43310 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTIFO43310 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTIFO43310 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTIFO43310 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTIFO43310 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTIFO43310 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTIFO43310 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CTIFO43310 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTIFO43310 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTIFO43310 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTIFO43310 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CTIFO43310 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CTIFO43310 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTIFO43310 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTIFO43310 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTIFO43310 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTIFO43310 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTIFO43310 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTIFO43310 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTIFO43310 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTIFO43310 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTIFO43310 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTIFO43310 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTIFO43310 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTIFO43310 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CTIFO43310 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTIFO43310 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTIFO43310 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTIFO43310 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTIFO43310 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTIFO43310 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTIFO43310 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTIFO43310 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTIFO43310 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTIFO43310 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTIFO43310 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTIFO43310 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTIFO43310 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTIFO43310 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTIFO43310 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTIFO43310 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTIFO43310 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTIFO43310 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTIFO43310 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTIFO43310 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTIFO43310 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CTIFO43310 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTIFO43310 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTIFO43310 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTIFO43310 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTIFO43310 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTIFO43310 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTIFO43310 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTIFO43310 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTIFO43310 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CTIFO43310 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTIFO43310 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTIFO43310 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTIFO43310 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTIFO43310 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTIFO43310 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTIFO43310 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTIFO43310 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTIFO43310 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTIFO43310 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
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