Protein–RNA interactions for Protein: O43283

MAP3K13, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K13O43283 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MAP3K13O43283 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAP3K13O43283 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms