Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ANKRD28O15084 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ANKRD28O15084 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD28O15084 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD28O15084 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD28O15084 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD28O15084 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD28O15084 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD28O15084 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD28O15084 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD28O15084 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD28O15084 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD28O15084 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD28O15084 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD28O15084 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD28O15084 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD28O15084 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD28O15084 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD28O15084 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD28O15084 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD28O15084 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD28O15084 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD28O15084 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD28O15084 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD28O15084 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD28O15084 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD28O15084 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD28O15084 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD28O15084 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD28O15084 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD28O15084 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD28O15084 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD28O15084 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD28O15084 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD28O15084 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD28O15084 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD28O15084 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD28O15084 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD28O15084 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD28O15084 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD28O15084 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD28O15084 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD28O15084 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD28O15084 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD28O15084 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD28O15084 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms