Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEURL1BA8MQ27 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEURL1BA8MQ27 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEURL1BA8MQ27 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEURL1BA8MQ27 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEURL1BA8MQ27 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEURL1BA8MQ27 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEURL1BA8MQ27 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEURL1BA8MQ27 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEURL1BA8MQ27 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEURL1BA8MQ27 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEURL1BA8MQ27 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEURL1BA8MQ27 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEURL1BA8MQ27 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEURL1BA8MQ27 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEURL1BA8MQ27 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEURL1BA8MQ27 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
NEURL1BA8MQ27 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEURL1BA8MQ27 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEURL1BA8MQ27 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEURL1BA8MQ27 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEURL1BA8MQ27 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEURL1BA8MQ27 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEURL1BA8MQ27 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEURL1BA8MQ27 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEURL1BA8MQ27 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEURL1BA8MQ27 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
NEURL1BA8MQ27 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEURL1BA8MQ27 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEURL1BA8MQ27 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEURL1BA8MQ27 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEURL1BA8MQ27 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEURL1BA8MQ27 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEURL1BA8MQ27 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEURL1BA8MQ27 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEURL1BA8MQ27 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEURL1BA8MQ27 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEURL1BA8MQ27 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEURL1BA8MQ27 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEURL1BA8MQ27 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEURL1BA8MQ27 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEURL1BA8MQ27 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
NEURL1BA8MQ27 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEURL1BA8MQ27 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEURL1BA8MQ27 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEURL1BA8MQ27 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEURL1BA8MQ27 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEURL1BA8MQ27 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
NEURL1BA8MQ27 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEURL1BA8MQ27 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEURL1BA8MQ27 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEURL1BA8MQ27 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEURL1BA8MQ27 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEURL1BA8MQ27 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEURL1BA8MQ27 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
NEURL1BA8MQ27 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEURL1BA8MQ27 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEURL1BA8MQ27 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEURL1BA8MQ27 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEURL1BA8MQ27 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEURL1BA8MQ27 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEURL1BA8MQ27 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEURL1BA8MQ27 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEURL1BA8MQ27 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEURL1BA8MQ27 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEURL1BA8MQ27 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEURL1BA8MQ27 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEURL1BA8MQ27 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEURL1BA8MQ27 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEURL1BA8MQ27 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEURL1BA8MQ27 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NEURL1BA8MQ27 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEURL1BA8MQ27 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEURL1BA8MQ27 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEURL1BA8MQ27 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEURL1BA8MQ27 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEURL1BA8MQ27 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEURL1BA8MQ27 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEURL1BA8MQ27 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEURL1BA8MQ27 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEURL1BA8MQ27 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEURL1BA8MQ27 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NEURL1BA8MQ27 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEURL1BA8MQ27 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEURL1BA8MQ27 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEURL1BA8MQ27 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEURL1BA8MQ27 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEURL1BA8MQ27 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NEURL1BA8MQ27 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEURL1BA8MQ27 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEURL1BA8MQ27 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEURL1BA8MQ27 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEURL1BA8MQ27 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NEURL1BA8MQ27 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEURL1BA8MQ27 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEURL1BA8MQ27 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEURL1BA8MQ27 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEURL1BA8MQ27 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEURL1BA8MQ27 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEURL1BA8MQ27 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms