Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GOLGA6L4A6NEF3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GOLGA6L4A6NEF3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GOLGA6L4A6NEF3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GOLGA6L4A6NEF3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GOLGA6L4A6NEF3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GOLGA6L4A6NEF3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GOLGA6L4A6NEF3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GOLGA6L4A6NEF3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GOLGA6L4A6NEF3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GOLGA6L4A6NEF3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GOLGA6L4A6NEF3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GOLGA6L4A6NEF3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GOLGA6L4A6NEF3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GOLGA6L4A6NEF3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GOLGA6L4A6NEF3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GOLGA6L4A6NEF3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GOLGA6L4A6NEF3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GOLGA6L4A6NEF3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GOLGA6L4A6NEF3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GOLGA6L4A6NEF3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GOLGA6L4A6NEF3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GOLGA6L4A6NEF3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GOLGA6L4A6NEF3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GOLGA6L4A6NEF3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GOLGA6L4A6NEF3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GOLGA6L4A6NEF3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GOLGA6L4A6NEF3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GOLGA6L4A6NEF3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GOLGA6L4A6NEF3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GOLGA6L4A6NEF3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GOLGA6L4A6NEF3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GOLGA6L4A6NEF3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GOLGA6L4A6NEF3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GOLGA6L4A6NEF3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GOLGA6L4A6NEF3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GOLGA6L4A6NEF3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GOLGA6L4A6NEF3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GOLGA6L4A6NEF3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GOLGA6L4A6NEF3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GOLGA6L4A6NEF3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GOLGA6L4A6NEF3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GOLGA6L4A6NEF3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GOLGA6L4A6NEF3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GOLGA6L4A6NEF3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GOLGA6L4A6NEF3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GOLGA6L4A6NEF3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
GOLGA6L4A6NEF3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GOLGA6L4A6NEF3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GOLGA6L4A6NEF3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GOLGA6L4A6NEF3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms