Protein–RNA interactions for Protein: A6NDR6

MEIS3P1, Putative homeobox protein Meis3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P1A6NDR6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MEIS3P1A6NDR6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
MEIS3P1A6NDR6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MEIS3P1A6NDR6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MEIS3P1A6NDR6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MEIS3P1A6NDR6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MEIS3P1A6NDR6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MEIS3P1A6NDR6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MEIS3P1A6NDR6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MEIS3P1A6NDR6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MEIS3P1A6NDR6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MEIS3P1A6NDR6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MEIS3P1A6NDR6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MEIS3P1A6NDR6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MEIS3P1A6NDR6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MEIS3P1A6NDR6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MEIS3P1A6NDR6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MEIS3P1A6NDR6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MEIS3P1A6NDR6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MEIS3P1A6NDR6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MEIS3P1A6NDR6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MEIS3P1A6NDR6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MEIS3P1A6NDR6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MEIS3P1A6NDR6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MEIS3P1A6NDR6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MEIS3P1A6NDR6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MEIS3P1A6NDR6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MEIS3P1A6NDR6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MEIS3P1A6NDR6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MEIS3P1A6NDR6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MEIS3P1A6NDR6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MEIS3P1A6NDR6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MEIS3P1A6NDR6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MEIS3P1A6NDR6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MEIS3P1A6NDR6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MEIS3P1A6NDR6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MEIS3P1A6NDR6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MEIS3P1A6NDR6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MEIS3P1A6NDR6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MEIS3P1A6NDR6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MEIS3P1A6NDR6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms