Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00862A6NCI5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00862A6NCI5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00862A6NCI5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00862A6NCI5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00862A6NCI5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00862A6NCI5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00862A6NCI5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00862A6NCI5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00862A6NCI5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00862A6NCI5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00862A6NCI5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00862A6NCI5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00862A6NCI5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00862A6NCI5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00862A6NCI5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00862A6NCI5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00862A6NCI5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00862A6NCI5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00862A6NCI5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00862A6NCI5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00862A6NCI5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00862A6NCI5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00862A6NCI5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00862A6NCI5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00862A6NCI5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00862A6NCI5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00862A6NCI5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00862A6NCI5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00862A6NCI5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00862A6NCI5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00862A6NCI5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00862A6NCI5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00862A6NCI5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00862A6NCI5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00862A6NCI5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00862A6NCI5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00862A6NCI5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00862A6NCI5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00862A6NCI5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00862A6NCI5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00862A6NCI5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00862A6NCI5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00862A6NCI5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00862A6NCI5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00862A6NCI5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00862A6NCI5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms