Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YXV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YXV3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
A0A0J9YXV3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms