Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms