Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
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