Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms